Τα τμήματα αυτά δίνουν τη δυνατότητα στους νέους της Μεσσηνίας, αλλά και των άλλων νομών της Περιφέρειας να επωφεληθούν των προνομίων για ναυτική φοίτηση. Συγκεκριμένα οι απόφοιτοι των τμημάτων αυτών μπορούν να μπουν στις σχολές του Εμπορικού Ναυτικού (ΑΕΝ) μόνο με το απολυτήριο ενδοσχολικών εξετάσεων, με προνομιακό ποσοστό 8%. Επίσης έχουν τη δυνατότητα να φοιτούν στα τμήματα αυτά και ταυτόχρονα να ναυτολογηθούν, προσθέτοντας έτσι θαλάσσια προϋπηρεσία. Επιπλέον, οι απόφοιτοι αυτών των τμημάτων μπορούν να καταταγούν στο Λιμενικό Σώμα σε θέση Λιμενοφυλάκων ύστερα από προκήρυξη του Υ.Ε.Ν. αποκλειστικά για απόφοιτους του Ναυτικού Τομέα.